Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLD3Q8IV08 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms