Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ATG4DQ86TL0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4DQ86TL0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ATG4DQ86TL0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ATG4DQ86TL0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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