Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms