Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LDLRAP1Q5SW96 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms