Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXD4L6Q3SYB3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXD4L6Q3SYB3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms