Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms