Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GEN1Q17RS7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GEN1Q17RS7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GEN1Q17RS7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GEN1Q17RS7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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GEN1Q17RS7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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GEN1Q17RS7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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