Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC142Q17RM4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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