Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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