Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HIF1AQ16665 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIF1AQ16665 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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