Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FXNQ16595 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FXNQ16595 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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