Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms