Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CNGA3Q16281 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CNGA3Q16281 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNGA3Q16281 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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