Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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