Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms