Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms