Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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