Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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