Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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BRD3Q15059 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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BRD3Q15059 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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BRD3Q15059 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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BRD3Q15059 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BRD3Q15059 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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BRD3Q15059 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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BRD3Q15059 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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