Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSHL1Q14406 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms