Protein–RNA interactions for Protein: Q14289

PTK2B, Protein-tyrosine kinase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2BQ14289 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTK2BQ14289 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTK2BQ14289 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTK2BQ14289 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PTK2BQ14289 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTK2BQ14289 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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PTK2BQ14289 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTK2BQ14289 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTK2BQ14289 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTK2BQ14289 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTK2BQ14289 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTK2BQ14289 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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