Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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