Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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