Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNW1Q13573 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms