Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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