Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RPA4Q13156 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPA4Q13156 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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