Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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