Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP160Q12769 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP160Q12769 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms