Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms