Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCDQ05655 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms