Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTN2Q02246 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms