Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XPCQ01831 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XPCQ01831 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
XPCQ01831 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPCQ01831 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPCQ01831 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPCQ01831 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPCQ01831 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XPCQ01831 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms