Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms