Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCQ00610 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTCQ00610 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms