Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms