Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
RPS29P62273 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms