Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LMO4P61968 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO4P61968 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO4P61968 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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