Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms