Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVPABLB-1P60509 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms