Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATP12AP54707 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms