Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms