Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms