Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5C1P36542 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms