Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms