Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RORAP35398 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RORAP35398 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms