Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTX2P32243 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OTX2P32243 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms