Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms