Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5DP30049 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms