Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms