Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB5P28074 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB5P28074 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms